そのファイルはスキップされ、エラーとして表示されます。ほかのファイルは通常どおり処理・ダウンロードされます。1つの不良ファイルがあっても、ほかの処理は止まりません。

いいえ。圧縮設定は一括処理全体に同じように適用されます。画像ごとに異なる設定が必要な場合は、1枚ずつ処理できる「画像を圧縮」ツールで個別に圧縮してください。